Изолиране на ДНК и РНК от FFPE туморно блокче (за TruSight Oncology Comprehensive)

Поради ограниченията на теста TruSight Oncology Comprehensive (TSO) (Изчерпателно Геномно Профилиране при онкологични заболявания, Comprehensive Genomic Profiling – CGP), преди извършване на изследването е необходимо да се оцени изолираният генетичен материал (ДНК и РНК) от FFPE туморното блокче.

Преди пристъпване към изследването за геномно профилиране с TruSight Oncology Comprehensive, парафиновото блокче ще бъде оценено от патолог, който ще определи процента туморно съдържание. Следва направата на срези с високо съдържание на туморни клетки. От селектираните срези се изолират ДНК и РНК, които се подготвят за секвениране от ново поколение (NGS). Преди извършване на NGS е необходимо туморният материал да премине качествен и количествен контрол.

В някои случаи може да се окаже, че пробата от туморното блокче не е подходяща за теста TruSight Oncology Comprehensive поради: проблеми с качеството на пробата, прекомерна ДНК фрагментация, недостатъчно материал, ниско съдържание на туморни клетки или други технически проблеми. В случай, че пробата се окаже неподходяща за извършване на теста изследването няма да се заплаща от пациента.

Ако ДНК и РНК са с необходимото качество и количество се пристъпва към извършване на изследването: TruSight Oncology Comprehensive (TSO) (Изчерпателно Геномно Профилиране при онкологични заболявания, Comprehensive Genomic Profiling – CGP).